Le 5émé programme de coopération (2008-2012) est basé sur le Plan-cadre des Nations Unies pour l’aide au développement (PNUAD). Il est aligné au plan national sur la stratégie nationale pour la réduction de la pauvreté, au plan continental sur le Plan de Maputo, la Charte Africaine pour la jeunesse et le Protocole additionnel relatif aux droits de la femme; et au plan international sur les OMD ainsi que sur les recommandations du Caire, du Caire +10, de Beijing et de Beijing+10 et sur le Plan Stratégique UNFPA 2008-2011.
Le programme de coopération 2008-2012 vise l’amélioration des conditions de vie des populations de la Guinée-Bissau à travers la promotion des services SR de qualité y compris le VIH/SIDA ; la prise en compte des interrelations entre population et développement ; la promotion d’un environnement propice pour l’égalité et l’équité du genre.